Grupa próbowała przełamać izraelską blokadę morską Gazy, zanim została przechwycona i zatrzymana przez siły izraelskie. Tłumy powitały Thunberg na międzynarodowym lotnisku w Atenach okrzykami „Wolność dla Palestyny”, gdy aktywiści i zwolennicy zgromadzili się, by ją powitać.
Władze izraelskie odrzuciły zarzuty o złe traktowanie deportowanych aktywistów, którzy w weekend zostali odesłani do krajów, w tym Turcji, Hiszpanii i Włoch. Prawnicy zajmujący się prawami człowieka reprezentujący uczestników flotylli twierdzą, że około 150 osób pozostaje w areszcie w Izraelu, w tym wnuk Nelsona Mandeli, Mandla Mandela.
Podobno kilku zatrzymanych prowadzi strajk głodowy, podczas gdy prawnicy oskarżają izraelskie władze o użycie nadmiernej siły i odmowę przyznania zatrzymanym ich praw — zarzuty te Izrael stanowczo odrzuca.
Izraelskie ministerstwo spraw zagranicznych poinformowało, że deportowani pochodzili z co najmniej 17 krajów, w tym Grecji, Francji, Szwecji, Wielkiej Brytanii i Stanów Zjednoczonych. Powtórzyło, że prawa aktywistów były respektowane podczas ich zatrzymania i oskarżyło jednego z uczestników o napaść na personel medyczny.
Przechwycenie flotylli wywołało powszechne protesty w kilku miastach na całym świecie, a wezwania do zakończenia blokady Gazy przez Izrael i zwiększenia odpowiedzialności za trwającą ofensywę militarną rosną.
